到武昌兵变以后，在湘鄂籍军官，组织湖北自治军；湘省也组织援鄂军；于7月29日，攻入湖北。8月初，连占蒲圻、通山、通城一带地方。9日，下令，免王占元，以萧耀南为湖北督军，吴佩孚为两湖巡阅使，孙传芳为长江上游总司令。吴佩孚以张福来率第三、第二十四两师当前敌，自与海军第二舰队司令杜锡珪，乘军舰督战。28日，北军陷岳州。9月1日，赵恒惕和吴佩孚在英国军舰上定约休战。岳州由北军驻扎，到湘省公布省宪之日撤退——其后湘省于1922年1月1日，公布省宪。驻扎岳州的客军，于1922年6月22日，奉令撤退。前敌总指挥张福来，于7月20日至27日，将各军实行撤退。
当湘鄂交战的时候，四川省亦发兵攻入湖北，占领巴东秭归，进围宜昌。吴佩孚也派兵往援。9月13日，吴佩孚自到宜昌，把川军打退。
中原之多故如此，而财政问题，又始终无法解决。第二次天津会议，靳总理也曾到场。当时有将交通部的特别会计，改为一般会计之说。旋由交通部发特种支付券五百万元，以维持内阁政费。然内阁仍于5月14日改组。改组之后，财长李士伟旋辞职，由次长潘复代理。11月5日，潘复辞，由农次高凌蔚代理。18日，靳云鹏辞职，由颜惠庆代理。12月14日，任命梁士诒为国务总理。次日，任命各阁员。