中共党、团员加入国民党后，势必与国民党原有党员争夺政治资源。国民党一大代表选举时，各地中共党员“居然以少数竞选胜利”，使一些老国民党人甚感不安和不快。一大产生的国民党中央执监委员会中，新加入的共产党人占了近四分之一的席位，一些重要的职能部门亦落入共产党人的掌控中。国民党中央党部从上海移驻广州，脱离了老党员聚集的中心地上海。党内新选任的干部大都是支持“容共”政策的中青年党员。过去长期得到孙中山倚重的一批老党员受到冷落，甚感失落和不满。如居正、谢持等人或不辞而别，或去乡下务农，以示消极抗议。另一位长期协助孙中山从事党务组织和宣传活动的田桐，在得知一大选举结果后，专程从上海赶赴广州，当面向孙中山“抗争三次”，不得结果，郁郁而归。
国民党一大闭幕后，孙中山任命共产党员谭平山为国民党中央组织部部长，负责国民党的组织发展工作。谭平山在分派人员筹建和拓展各地地方党务时，自然更多地依靠共产党员和青年团员，从而使不少国民党地方党部落入共产党人的掌控中。这难免影响了相关地区国民党人的既得利益。一些地方的工会、学生会等民众团体和基层党部，相继出现两党党员的纠纷与冲突，有的展开理论争辩，有的由文斗演为武斗。