黄巢起义失败后，他的老部下朱温先后骗取了唐僖宗与唐昭宗的信任，崛起为中原最强的军阀，并对长安城进行了毁灭性破坏。为了篡夺皇位，朱温强迫唐昭宗迁都洛阳，强制长安人迁居，挨家挨户将城中建筑拆毁，并将木板投入水中，顺流而下。长安城中的百姓为此号哭月余，痛骂朱温。
晚唐诗人韦庄在《长安旧里》一诗中记载了当时的惨状：“满目墙匡春草深，伤时伤事更伤心。车轮马迹今何在，十二玉楼无处寻。”经此一劫，长安城再次沦为废墟，建都的历史至此终结。
长安作为都城的历史终结了，但中国人的长安情结永远解不开。唐朝以后，长安虽然再也没有成为统一政权的国都，但一直是历代王朝的西北重镇，有着极为特殊的地位。
宋太祖赵匡胤不能迁都洛阳，却许下搬家到长安的心愿：“迁河南未已，终当居长安耳。”元朝的开国皇帝忽必烈，与明朝的开国皇帝朱元璋，都将爱子封到陕西，在长安故地建立了宏伟的王城。
忽必烈之子忙哥剌的安西王府，仿佛盛世长安复兴的昙花一现，其安西王宫“斡耳朵”，堪比大都皇宫，旅行家马可·波罗为之赞叹不已，说“比这再好的是没有了”。