三品以上官、读书识字人、长安市民自然成了黄巢的敌人。唐勤王兵四面来会，巢势渐衰弱，巢大将朱温降唐，授同华节度使招讨副使，赐名全忠。唐又召沙陀李克用（李国昌子）入援，克用将胡兵四万渡河击巢。中和三年，克用大破巢军，诸军继进，巢力战不胜，率众由蓝田逃入商山。唐兵进城，烧杀掠夺，长安居民及房屋，所存无几。巢军沿路遗弃辎重、珍宝，唐军争拾，不急追逐。巢出商山入河南境，攻破蔡州，节度使秦宗权大败请降。巢率兵攻陈州，刺史赵犨坚守不下，巢纵兵攻掠洛、许、汝、唐、邓、孟、郑、汴、曹、濮、徐、兖等数十州。四年，唐大将周岌、时溥、朱全忠屡败不能支，共遣使向李克用求救，克用将兵五万自河东来援。朱全忠退守大梁，尚让进逼，全忠向克用告急，克用追巢至中牟，大败巢军，杀万余人，巢军溃。尚让投降时溥，别将葛从周等降朱全忠。巢率余众千人逃兖州。克用追至冤句，粮尽回汴求粮。朱全忠固请入城，置酒灌克用大醉，发兵袭击克用，克用死战，跳南门出城。克用回许州。请周岌助粮，岌拒不给，克用率兵归河东。