叶德辉以康有为援用今文经说为“离经叛道”，张之洞对康有为的“孔子改制”说也始终反对。康有为在外患日深的情况下宣传保国、保教，张之洞则以“明礼教之原本，人禽之大防”以“保教”[10]，“陈述本朝德泽深厚，使薄海臣民咸怀忠良以保国”[11]。他们之间的分歧，也是以经学为形式而展开的思想斗争和政治斗争。
近代中国，又是遭受外来资本、帝国主义的侵略灾难深重的时代，在严重的民族危机下，不同学派也会一致御侮救亡。甲午战后，康有为、梁启超等运用今文“微言”，宣传变法维新，组织强学会，创刊《时务报》。本来是俞樾的学生，并以“私淑”首先宣扬古文经籍的刘歆（子骏）自居的章太炎，却也助资强学会，任职《时务报》，与康门弟子共事；并在当时所撰文篇中，有着沾染今文的迹象。如《论学会有大益于黄人亟宜保护》说：“是故整齐风俗，范围不过，若是曰大一统；益损政令，九变复贯，若是曰通三统。‘通三统’者，虽殊方异俗，苟有长技则取之”。“吾闻《齐诗》五际之言曰：午亥之际为革命，卯酉之际为革政。……变郊号，柴社稷，谓之革命；礼秀民，聚俊才，谓之革政。今之亟务，曰：以革政挽革命”。“通三统”是《春秋》公羊家言，《齐诗》传者喜以阴阳灾异推论时政，它们都是今文经说。